Préconisations pour les prélèvements bactériologiques et virologiques à destination des professionnels de santé

Il existe différents types d’écouvillon et milieu de transport en fonction du site à prélever et de la recherche à effectuer.

ECOUVILLONS ESWAB avec milieu de transport AMIES

Indications

  • Bactériologie classique (bactéries aérobies, anaérobies, y compris gonocoque)
  • Mycologie (recherche de candidose).
  • Recherche par PCR de Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, Mycoplasma genitalium, Trichomonas vaginalis.

Conservation

  • 48h à température ambiante sauf pour Neisseria gonorrhoeae 24h.

ECOUVILLONS Greiner avec tube de stabilisation de virus VACUETTE®

Indications

  • Prélèvements nasopharyngés pour recherche de SARS-Cov-2, VRS et grippe.

Conservation

  • 48h impérativement réfrigérée.

ECOUVILLONS avec milieu de transport REMEL

Indications

  • Prélèvement nasopharyngé pour recherche par PCR de Bordetella pertussis et parapertussis (coqueluche)

Conservation

  • 48h impérativement réfrigérée.

ECOUVILLONS ESWAB avec milieu de transport UTM-RT

Indications

  • Recherche par PCR d’Herpès simplex virus 1 et 2.

Conservation

  • 48h impérativement réfrigérée.

Réalisation du prélèvement

NB: Tout prélèvement doit être identifié (a minima nom et prénom) et réalisé avant traitement. La date et l’heure de prélèvement ainsi que les renseignements cliniques (date et nature des traitements antérieurs, évolution, aspect…) sont indispensables.

Procédure

  • Ecouvillonner le site à prélever.
  • Introduire l’écouvillon dans le tube, le casser en le pliant. Fermer le tube.
  • Identifier le tube et remplir la fiche de transmission de prélèvement fournie avec les écouvillons, indiquer la date et l’heure de prélèvement ainsi que la localisation, les renseignements cliniques et traitements pris, en cours et/ou prévus. En l’absence de fiche de transmission, reporter l’ensemble de ces informations sur l’ordonnance.

Informations complémentaires

Notes pour les prélèvements vaginaux :

  • Prélever au niveau de l’endocol et des culs de sacs vaginaux avec le même écouvillon.
  • Chez la femme enceinte, l’auto-prélèvement est validé pour toutes les recherches.
  • En dehors de la grossesse, l’auto-prélèvement peut être proposé pour la recherche spécifique par PCR de Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae et Mycoplasma genitalium.

Notes pour la recherche par PCR de C trachomatis, N gonorrhoeae, M genitalium et T. Vaginalis

  • Chez la femme, privilégier la recherche sur prélèvement vaginal, même pendant la menstruation.
  • Chez l’homme, privilégier la recherche sur 1er jet urinaire.
  • Les urines ne sont pas mises en culture. La réalisation d’un antibiogramme, pour surveillance des résistances des gonocoques, n’est donc pas possible. Chez l‘homme, en cas de suspicion de gonococcie (écoulement urétral important), effectuer, en plus, un écouvillonnage du méat urinaire ou pratiquer directement un prélèvement urétral.
  • Attendre au moins 4 semaines après la fin d’un traitement pour effectuer un éventuel contrôle.

Notes pour prélèvement nasopharyngé pour recherche de coqueluche, coronavirus, grippe et VRS

  • Insérer l’écouvillon dans la narine le plus loin possible parallèlement au palais et le retirer délicatement en imprimant un léger mouvement rotatif. Recommencer ce geste dans l’autre narine avec le même écouvillon.
  • Pour la coqueluche, la recherche ne doit être effectuée que si le patient tousse depuis moins de 3 semaines et s’il est vacciné depuis plus de 3 ans (ou si son statut vaccinal est inconnu).

Note pour la recherche d’herpès

  • Bien frotter le plancher des lésions ulcérées ou vésiculeuses.